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Ici, vous trouverez un bref aperçu de mes travaux et intérêts de recherches passés.
Écologie génomique chez les levures.
Les levures du genre Saccharomyces sont parmis les modèles eucaryotes les plus puissants, avec lesquels il est possible de disséquer les processus évolutifs complexes de la spéciation et de l'adaptation. J'utilise les populations naturelles de S. paradoxus, l'espèce soeur de S. cerevisiae, comme modèle pour comprendre les bases écologiques, biologiques et moléculaires de ces processus.
Grâce à une importante campagne d'échantillonnage dans la province du Québec (Canada) et à des collaborateurs en Amérique du nord-est, nous avons constitué une importante collection de souches représentatives de la diversité de cette espèce. Nous avons identifié deux principales lignées génétiques de S. paradoxus distribuées selon un cline nord/sud, suggérant que des facteurs climatiques ont pu jouer un rôle dans la divergence entre ces deux lignées. En accord avec leur distribution géographique, ces lignées répondent différement aux variations climatiques et les performances individuelles des souches sont corrélées avec les conditions climatiques locales au lieu d'échantillonnage. Ces résultats fournissent la première évidence que, comme chez les organismes "supérieurs", les populations de micro-organismes peuvent subir une adaptation climatique locale et de ce fait, peuvent être affectées par le réchauffement climatique.
Nous avons montré que les lignées de S. paradoxus, en dépit du chevauchement de leurs aires de répartition, sont isolées reproductivement, suggérant qu'elles représentent un évènement de spéciation en cours. Fait intéressant, la distribution géographique de ces deux jeunes "espèces" ressemble à celles d'espèces post-glaciaires d'arbres, de poissons et de drosophiles, suggérant que cette spéciation est le résultat de la dernière glaciation. Nous avons apporté de solides preuves que l'isolement reproducteur est ici corrélé avec d'importants réarangements chromosomiques observés à l'intérieur des lignées, suggérant que ces réarangements pouvaient être un méchanisme déterminant dans l'initiation de la spéciation.
Nous avons utilisé une approche génomique dans les populations Nord-Américaines de Saccharomyces paradoxus pour disséquer les mécanismes d'hybridation et de réarrangements chromosomiques sous-jacents les toutes premières étapes de la spéciation écologique.
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